同源模建使用Modeller 9.13程序和EasyModeller 2.0图形操作界面，由程序自动生成10个模型，根据打分值选取PDF Total Energy及DOPE Score均最低的模型作为目标蛋白。蛋白三维结构及显示采用Discovery Studio 4.0 (DS)程序。

    1.3.2 动力学优化 由于同源模建的蛋白存在一定的不合理因素，需要对其进行能量优化。本研究采用逐级能量最小化策略，即先约束所有重原子，优化氢原子;再约束保守跨膜区，优化侧链及Loop区;最后优化跨膜区[11]。每次约束均以最陡下降法(steepest descent)2 000步和共轭梯度法(conjugate gradient)5 000步进行优化。

    1.4 分子对接及中药活性成分筛选

    为精确考察分子间的结合模式，本研究利用DS中Flexible Docking模块进行受体与配体间的全柔性分子对接，在此过程中蛋白的侧链和配体分子构象都可以自由变化 ......