人参根际拮抗细菌RS—3的鉴定及其对人参常见病原菌的抑制作用(1)
[摘要] 从吉林健康人参根中筛选到一株广谱根际菌RS-3。经形态学特征及16SrDNA 序列同源性分析，鉴定该菌株为解淀粉芽孢杆菌。平板对峙实验及带毒平板法鉴定，该菌株对常见的5种人参病原菌有一定的拮抗作用，对灰霉病菌的抑菌率达54.4%。说明根际细菌RS-3可作为人参常见病害的潜在广谱生防菌进一步开发利用。
[关键词] 人参；根际细菌；抑菌活性
[Abstract] A rhizobacteria strain named RS-3 exhibited inhibitory activity against all five Panax ginseng pathogens was isolated from the root of P. ginseng. This strain was identified as Bacillus amyloliquefaciens based on its morphological character and 16S rDNA sequence. Antagonistic activity experiments indicated that the strain could strongly suppress Botrytis cinerea Pers with an inhibitory rate of 54.4%，suggesting the potentialities of biocontrol agent against diseases that frequently happen on ginseng.
[Key words] Panax ginseng；rhizobacteria；antibacterial activity
doi：10.4268/cjcmm20162413
人参Panax ginseng C. A. Mey为五加科人参属多年生草本植物，主要分布于东北吉林、辽宁、黑龙江等地区。其野生资源稀少，被“国家重点保护野生药用动植物名录”列为一类保护植物[1-3]。人参有几千年的药用历史，具有滋补强壮、安神益智的作用，在国内外中药领域占有极其重要的地位[4]。近年来，随着人参需求量增加，野生人参已不能满足需求，人工栽培的规模不断扩大，人参各类病害也愈加严重等问题，制约了人参种植业的可持续发展。
人参连作障碍主要为根部病害，多从根部开始侵染，采用化学农药防治必须将其施入土壤[5]。由于土壤对农药的吸附、迁移等一系列复杂作用及土壤中微生物对农药的降解，严重影响了化学农药的防效；若过度加大用量，不仅会增加生产成本，而且导致人参根内农残量大幅度增加，失去药用价值。因此，根用药用植物的土传病害防治不能单纯依靠化学农药，必须探索新的防治途径。因而筛选对人参根部病害有抗菌作用的生防菌进行生物防治显得尤为必要[6]。
植物根际细菌，特别是药用植物根际细菌，作为一种新的资源引起了人们的广泛关注，目前，对人参根际菌的研究尚处在初级阶段。张一鸣等[9-10]开展了人参根际土壤提取物对人参病原菌和拮抗菌的影响研究。肖春萍等[11]开展了人参根际土壤微生物多样性及其生防真菌资源开发研究工作。本实验筛选出一株具有广谱抑菌活性的根际细菌，初步研究了其对人参常见病菌抑菌活性，旨在筛选出能产生抑菌活性物质的根际菌，为发酵生产抑菌活性物质及人参资源的综合开发奠定基础。
1 材料
1.1 土壤采集 土壤样品采自吉林通化集安三年生健康人参的根际土壤10 cm处。
1.2 供试培养基 LB培养基：胰蛋白胨 10 g；酵母提取物 5 g；NaCl 10 g。加水定容至1 L，调至pH 7.0。121 ℃，灭菌20 min，固体培养基琼脂为1.5%。
1.3 菌株分离 称取10 g土壤样品，于盛有90 mL無菌水的三角瓶中振荡30 min。取1 mL土壤悬浮液，依次10倍梯度稀释至1×10-7。分别取1×10-3，1×10-4，1×10-5浓度的土壤悬浮液各100 μL均匀涂布于LB平板上。每个浓度梯度重复3皿。28 ℃恒温培养24～48 h。从平板上挑取不同菌落形态的单菌落，于LB 平板上划线纯化培养，并编号保存。
2 方法
2.1 形态特征描述 依据伯杰氏细菌培养性状判定方法，描述分离菌在LB培养基上 37 ℃培养24 h后的单菌落特征。
2.2 菌株 RS-3的分子鉴定 根据16SrDNA序列对菌株进行分子鉴定。采用SDS法提取菌株RS-3基因组DNA。利用细菌16SrDNA序列通用引物F14(5′-AACAGGATTAGATACCCTG-3′)和R1492(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)进行PCR扩增。PCR扩增体系及条件如下：2×PCR Mix，25 μL；模板 DNA，2 μL；引物各1 μL；ddH2O 补足至50 μL。扩增条件：94 ℃ 3 min；94 ℃ 30 s，65 ℃ 30 s，72 ℃ 90 s，共35个循环；最后72 ℃延伸10 min，4 ℃保存。
PCR扩增产物经胶回收，pEASY-T载体连接，Trans 5α转化涂板，蓝白斑筛选和菌液PCR验证的阳性克隆送北京华大生物技术有限公司测序。获得的序列在NCBI中比对搜索，确定分类地位。
2.3 RS-3对人参常见病原菌拮抗作用测定 平板对峙培养法测定拮抗作用。供试人参病原菌在PDA平板上培养8 d，取直径0.5 cm的菌饼接种于PDA培养基中心。然后用接种环蘸取细菌RS-3菌株在菌饼的两侧约4 cm处划线，25 ℃黑暗培养7 d，测量抑菌带的宽度，并记录统计。每个处理重复3次，观察并测量拮抗带[12]。带毒平板法：RS-3菌株于LB 液体培养基中，180 r·min-1，37 ℃恒温振荡培养至A6001.5。将菌悬液在12 000 r·min-1离心1 min，上清液经0.22 μm孔径的滤膜过滤得到无菌滤液。待 PDA 培养基冷却到50 ℃左右时加入无菌滤液(1∶9)，混匀后倒平板。取直径0.5 cm病原菌菌饼置于 PDA 培养基平板中间，25 ℃恒温培养7 d，观察抑菌效果。 (王铁霖 赵东岳 陈美兰 马忠华 郭兰萍)
[关键词] 人参；根际细菌；抑菌活性
[Abstract] A rhizobacteria strain named RS-3 exhibited inhibitory activity against all five Panax ginseng pathogens was isolated from the root of P. ginseng. This strain was identified as Bacillus amyloliquefaciens based on its morphological character and 16S rDNA sequence. Antagonistic activity experiments indicated that the strain could strongly suppress Botrytis cinerea Pers with an inhibitory rate of 54.4%，suggesting the potentialities of biocontrol agent against diseases that frequently happen on ginseng.
[Key words] Panax ginseng；rhizobacteria；antibacterial activity
doi：10.4268/cjcmm20162413
人参Panax ginseng C. A. Mey为五加科人参属多年生草本植物，主要分布于东北吉林、辽宁、黑龙江等地区。其野生资源稀少，被“国家重点保护野生药用动植物名录”列为一类保护植物[1-3]。人参有几千年的药用历史，具有滋补强壮、安神益智的作用，在国内外中药领域占有极其重要的地位[4]。近年来，随着人参需求量增加，野生人参已不能满足需求，人工栽培的规模不断扩大，人参各类病害也愈加严重等问题，制约了人参种植业的可持续发展。
人参连作障碍主要为根部病害，多从根部开始侵染，采用化学农药防治必须将其施入土壤[5]。由于土壤对农药的吸附、迁移等一系列复杂作用及土壤中微生物对农药的降解，严重影响了化学农药的防效；若过度加大用量，不仅会增加生产成本，而且导致人参根内农残量大幅度增加，失去药用价值。因此，根用药用植物的土传病害防治不能单纯依靠化学农药，必须探索新的防治途径。因而筛选对人参根部病害有抗菌作用的生防菌进行生物防治显得尤为必要[6]。
植物根际细菌，特别是药用植物根际细菌，作为一种新的资源引起了人们的广泛关注，目前，对人参根际菌的研究尚处在初级阶段。张一鸣等[9-10]开展了人参根际土壤提取物对人参病原菌和拮抗菌的影响研究。肖春萍等[11]开展了人参根际土壤微生物多样性及其生防真菌资源开发研究工作。本实验筛选出一株具有广谱抑菌活性的根际细菌，初步研究了其对人参常见病菌抑菌活性，旨在筛选出能产生抑菌活性物质的根际菌，为发酵生产抑菌活性物质及人参资源的综合开发奠定基础。
1 材料
1.1 土壤采集 土壤样品采自吉林通化集安三年生健康人参的根际土壤10 cm处。
1.2 供试培养基 LB培养基：胰蛋白胨 10 g；酵母提取物 5 g；NaCl 10 g。加水定容至1 L，调至pH 7.0。121 ℃，灭菌20 min，固体培养基琼脂为1.5%。
1.3 菌株分离 称取10 g土壤样品，于盛有90 mL無菌水的三角瓶中振荡30 min。取1 mL土壤悬浮液，依次10倍梯度稀释至1×10-7。分别取1×10-3，1×10-4，1×10-5浓度的土壤悬浮液各100 μL均匀涂布于LB平板上。每个浓度梯度重复3皿。28 ℃恒温培养24～48 h。从平板上挑取不同菌落形态的单菌落，于LB 平板上划线纯化培养，并编号保存。
2 方法
2.1 形态特征描述 依据伯杰氏细菌培养性状判定方法，描述分离菌在LB培养基上 37 ℃培养24 h后的单菌落特征。
2.2 菌株 RS-3的分子鉴定 根据16SrDNA序列对菌株进行分子鉴定。采用SDS法提取菌株RS-3基因组DNA。利用细菌16SrDNA序列通用引物F14(5′-AACAGGATTAGATACCCTG-3′)和R1492(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)进行PCR扩增。PCR扩增体系及条件如下：2×PCR Mix，25 μL；模板 DNA，2 μL；引物各1 μL；ddH2O 补足至50 μL。扩增条件：94 ℃ 3 min；94 ℃ 30 s，65 ℃ 30 s，72 ℃ 90 s，共35个循环；最后72 ℃延伸10 min，4 ℃保存。
PCR扩增产物经胶回收，pEASY-T载体连接，Trans 5α转化涂板，蓝白斑筛选和菌液PCR验证的阳性克隆送北京华大生物技术有限公司测序。获得的序列在NCBI中比对搜索，确定分类地位。
2.3 RS-3对人参常见病原菌拮抗作用测定 平板对峙培养法测定拮抗作用。供试人参病原菌在PDA平板上培养8 d，取直径0.5 cm的菌饼接种于PDA培养基中心。然后用接种环蘸取细菌RS-3菌株在菌饼的两侧约4 cm处划线，25 ℃黑暗培养7 d，测量抑菌带的宽度，并记录统计。每个处理重复3次，观察并测量拮抗带[12]。带毒平板法：RS-3菌株于LB 液体培养基中，180 r·min-1，37 ℃恒温振荡培养至A6001.5。将菌悬液在12 000 r·min-1离心1 min，上清液经0.22 μm孔径的滤膜过滤得到无菌滤液。待 PDA 培养基冷却到50 ℃左右时加入无菌滤液(1∶9)，混匀后倒平板。取直径0.5 cm病原菌菌饼置于 PDA 培养基平板中间，25 ℃恒温培养7 d，观察抑菌效果。 (王铁霖 赵东岳 陈美兰 马忠华 郭兰萍)