1.3 数据的拼接与组装 经测序获得的原始序列(raw reads)，去除里面含有带接头的、低质量的reads，评估测序数据质量，并对测序数据进行过滤，从而获得干净序列(clean reads)。本研究采用Trinity[8]对clean reads进行拼接。该软件通过序列之间的重叠(overlap)信息组装得到重叠群(contigs)，然后局部组装得到转录本(transcripts)，最后用 TGICL和 Phrap 软件对转录本进行同源聚类和拼接得到单基因簇(unigene)。

    1.4 功能注释与分类 通过blastx将拼接所得unigene比对到Nr[10](Non-redundant protein database，非冗余蛋白数据库)，Nt，Swiss-Prot(SwissProt protein database，蛋白质序列数据库)，GO[11](Gene Ontology，基因本体论数据库)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes ......