32ISSR遗传距离和遗传一致度利用POPGENE计算了居群间Nei′s遗传距离(D)和遗传一致度(I)。D变化范围为 0111 5～0431 2，平均 0257 8，I的变化范围为0649 7～0894 5，平均 0774 3(表3)，其中采自于SCDJY，SCQCS的这2个居群的I最高(0894 5)，SCCD，CQTN的I最低(0649 7)。

    33ISSR聚类分析基于遗传一致度，利用 UPGMA法进行聚类分析，建立15个居群柔毛淫羊藿亲缘关系树状图(图2)。15个居群的柔毛淫羊藿聚为3大类：第Ⅰ类最为复杂，包括SCQW，SCQS，SCCZ，SCQL，SCBC，SCLC，SCDJY，SCQCS，SCHY，SCBZ 10个居群；第Ⅱ类有HBSY，SXNZ，SCCD，SCYA 4个居群；第Ⅲ类为CQTN 1个居群。

    利用NTSYS pc21 对所有个体进行聚类分析，结果表明共有11个居群为全部个体聚在一起，各自成为一个独立分支，如SCHY，SCQW，SCCZ，SCQL，SCBC，SCCD，SCDJY，SCQCS，CQTN，HBSY，SXNZ。另外的4个居群中，SCQS的12个个体中，9个体聚为独立一支，2个个体和SCBZ的11个体聚为一个分支；SCLC的11个个体中，5个个体单独聚在一起，离CQTN的分支比较近，另外6个聚为一支，与SCYA的3个比较近；SCBZ的13个个体中 ......