1990年FAO/WHO首先提出比较法，即把转基因食品作物与相应的亲本作物进行比较来评价转基因食品的相对安全性。

    1993年经济合作和发展组织(OECD)生物技术安全性专家组提出实际等同性概念。即一个转基因食品经化学鉴定与其亲本作物“实际等同”就被认为无新的健康危险性，不再进行膳食摄入量，以及营养学和毒理学评价。

    1996年国际生命科学会(ILSI)欧洲分会提出等同性和相似性定标法将转基因食品分为三类。

    第一类：这类转基因食品与传统对照食品或原料实际等同。生物的每个代谢物清楚，人摄入量与相似传统食品相差不大，全部DNA来自亲本生物，基因水平与亲本相同。这类转基因食品不需更深入的资料即可做出安全性评价。如Zeneea公司制成的转基因番茄酱与对照番茄酱36个化学指标分析结果与对照比较相关水平达到98.9%，且不含基因产物，故可评为“实际等同”。

    第二类：这类转基因食品与传统对照食品和原料十分相似，但某些性质有差别。具有或没有某种新的成分或性质，对新食品中新成分要重点进行安全性评价。

    第三类：这类转基因食品与传统食品既不等同也不类似 ......